microbiomeDataSets

DOI:10.18129 / B9.bioc.microbiomeDataSets

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅microbiomeDataSets。

基于微生物数据集实验中心

Bioconductor版本:3.15

microbiomeDataSets是微生物组的集合数据集加载Bioconductor ExperimentHub的基础设施。工作流的数据集作为参考和小品文发表毗邻Bioconductor微生物分析工具。可以添加额外的数据集加班和添加作者是受欢迎的。

作者:狮子座拉赫蒂(cre, aut)Felix通用恩斯特(aut),苏达山谢蒂(aut),Chouaib Benchraka(施)时候,Yagmur姆塞克(施)

维护人员:狮子座拉赫蒂<狮子座。拉赫蒂在iki.fi >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“microbiomeDataSets”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“microbiomeDataSets”)

HTML	R脚本	microbiomeDataSets
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,MicrobiomeData,SequencingData
版本	1.4.0
许可证	CC0
取决于	R (> = 4.1),SummarizedExperiment,TreeSummarizedExperiment,MultiAssayExperiment
进口	方法,跑龙套,BiocGenerics,ExperimentHub,Biostrings,猿
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle,SingleCellExperiment,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	米娅,miaViz
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	microbiomeDataSets_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/microbiomeDataSets
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ microbiomeDataSets
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/microbiomeDataSets/
包下载报告	下载数据