MethylSeqData

DOI:10.18129 / B9.bioc.MethylSeqData

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MethylSeqData。

公共DNA甲基化测序数据集的集合

Bioconductor版本:3.15

级(即cytosine-level)重要公共bisulfite-seq数据集的集合(例如,WGBS和rrb),作为SummarizedExperiment对象提供样本和基准面的元数据。

作者:彼得·希基(aut (cre)

维修工:彼得希<彼得。希在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MethylSeqData”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“MethylSeqData”)

HTML	R脚本	用户指南
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文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,Homo_sapiens_Data,MethylSeqData,Mus_musculus_Data,SequencingData
版本	1.6.0
许可证	CC0
取决于	SummarizedExperiment
进口	ExperimentHub,HDF5Array,rhdf5,GenomeInfoDb,S4Vectors,GenomicRanges统计数据,IRanges,跑龙套
链接
建议	BiocFileCache,BiocStyle,data.table,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MethylSeqData_1.6.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MethylSeqData
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MethylSeqData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MethylSeqData/
包下载报告	下载数据