IHWpaper

DOI:10.18129 / B9.bioc.IHWpaper

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅IHWpaper。

再现人物IHW纸

Bioconductor版本:3.15

这个包方便包装所有功能需要复制的数据IHW纸(https://www.nature.com/articles/nmeth.3885)和https://rss.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/rssb.12411的数据分析,参看了arXiv预印(http://arxiv.org/abs/1701.05179)。因此它是一个同伴包Bioconductor IHW包。

作者:Nikos Ignatiadis (aut (cre)

维修工:Nikos Ignatiadis < Nikos。在gmail.com ignatiadis01 >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“IHWpaper”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“IHWpaper”)

HTML	R脚本	NMeth纸:解释热带病研究和培训特别规划
HTML	R脚本	NMeth纸:IHW-Bonferroni模拟
HTML	R脚本	NMeth纸:真实数据的例子
HTML	R脚本	NMeth纸:模拟数据
HTML	R脚本	NMeth纸:分层柱状图
HTML	R脚本	统计数据:与IHW-Benjamini-Yekutieli hQTL分析
HTML	R脚本	不同:BH解释/可视化
HTML	R脚本	不同:Grenander估计应用于IHW (vs ECDF)
HTML	R脚本	各种真实数据的例子:1-fold权函数
HTML	R脚本	不同:tdr和pvalue排斥地区
HTML	R脚本	不同:重量和独立的过滤
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData,ExpressionData,RNASeqData,ReproducibleResearch
版本	1.24.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.3),IHW
进口	Rcpp、统计数据、样条函数方法,跑龙套,DESeq2,SummarizedExperiment,fdrtool,genefilter,qvalue,Biobase,BiocGenerics,BiocParallel,dplyr、网格ggplot2,cowplot
链接	Rcpp
建议	testthat,RColorBrewer,wesanderson,尺度,gridExtra,BiocStyle,knitr,rmarkdown,气道,locfdr,tidyr,latex2exp
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	IHWpaper_1.24.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IHWpaper
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ IHWpaper
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/IHWpaper/
包下载报告	下载数据