SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109

DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109。

SNP地点智人(dbSNP构建132)

Bioconductor版本:3.15

SNP等位基因位置和智人从NCBI dbSNP建造132。源数据文件用于这个包是由NCBI 2010年11月9日,包含snp GRCh37映射到参考基因组。警告:请注意,GRCh37基因组是一样的hg19从UCSC基因组除了线粒体染色体。因此,单核苷酸多态性在这个包可以在BSgenome.Hsapiens.UCSC“注入”。hg19但这注入排除chrM(即序列将被注入无关)。

作者:Herve页面

维修工:h .页< hpages.on。github在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData,遗传学,Homo_sapiens,SNPlocs
版本	0.99.9
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.10),IRanges,GenomicRanges
进口	方法,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges
链接
建议	Biostrings,BSgenome(> = 1.16.1),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	VariantAnnotation
我的链接

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109_0.99.9.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP.20101109/
包下载报告	下载数据