chipseqDBData

DOI:10.18129 / B9.bioc.chipseqDBData

chipseqDB工作流的数据

Bioconductor版本:发行版(3.15)

为ChIP-seq库排序和索引BAM文件，以便在chipseqDB工作流中使用。BAM指数也包括在内。

作者:Aaron Lun [aut, cre]

维护者:Aaron Lun 的键盘

安装

要安装此包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("chipseqDBData")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“chipseqDBData”)

超文本标记语言	R脚本	文件清单和统计信息
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeqData,ExperimentData,ExperimentHub,SequencingData
版本	1.12.0
许可证	Cc乘4.0
取决于
进口	AnnotationHub,ExperimentHub,Rsamtools,S4Vectors
链接
建议	knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	csawBook
进口我
建议我	chipseqDB
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	chipseqDBData_1.12.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chipseqDBData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/chipseqDBData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/chipseqDBData/
软件包下载报告	下载数据