wiggleplotr

DOI:10.18129 / B9.bioc.wiggleplotr

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅wiggleplotr。

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Bioconductor版本:3.15

工具会想象阅读覆盖从测序实验一起基因组注释(基因、转录、峰值)。内含子的成绩单可以新固定长度为更好地可视化其实阅读报道。

作者:Kaur Alasoo (aut (cre)

维护人员:Kaur Alasoo <考尔。在gmail.com alasoo >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“wiggleplotr”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“wiggleplotr”)

HTML	R脚本	介绍wiggleplotr
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文本		新闻

细节

biocViews	AlternativeSplicing,ChIPSeq,报道,GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,转录,可视化
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	Apache 2.0许可
取决于	R (> = 3.6)
进口	dplyr,ggplot2(> = 2.2.0),GenomicRanges,rtracklayer,cowplot,为了,purrr,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb
链接
建议	knitr,rmarkdown,biomaRt,GenomicFeatures,testthat,ensembldb,EnsDb.Hsapiens.v86,org.Hs.eg.db,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene,AnnotationDbi,AnnotationFilter
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	wiggleplotr_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	wiggleplotr_1.20.0.zip
macOS二进制(x86_64)	wiggleplotr_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/wiggleplotr
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ wiggleplotr
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/wiggleplotr/
包下载报告	下载数据