毒蛇
DOI:10.18129 / B9.bioc.viper
这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅毒蛇。
虚拟的推理Protein-activity丰富调节子分析
Bioconductor版本:3.15
从基因表达数据推断蛋白质的活动,包括毒蛇和msVIPER算法
作者:马里亚诺·J阿尔瓦雷斯< reef103 gmail.com >
维修工:马里亚诺·J阿尔瓦雷斯< reef103 gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“毒蛇”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“毒蛇”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“毒蛇”)
| R脚本 | 使用毒蛇 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | FunctionalPrediction,GeneExpression,GeneRegulation,NetworkEnrichment,软件,SystemsBiology |
| 版本 | 1.30.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(8.5年) |
| 许可证 | 文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 2.14.0),Biobase、方法 |
| 进口 | mixtools、统计、并行,e1071,KernSmooth |
| 链接 | |
| 建议 | bcellViper |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | aracne.networks,火神 |
| 进口我 | diggit,diggitdata,多萝西娅,研制 |
| 建议我 | 解耦,MethReg,现代艺术博物馆 |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | viper_1.30.0.tar.gz |
| Windows二进制 | viper_1.30.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | viper_1.30.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/viper |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/毒蛇 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/viper/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
