traviz

DOI:10.18129 / B9.bioc.traviz

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅traviz。

轨迹函数可视化和解释。

Bioconductor版本:3.15

traviz提供一套功能绘制轨迹相关对象从Bioconductor包。它允许绘制轨迹在降低维度,以及averge基因表达流畅拟时间的函数。旁白从通用效用函数,traviz还允许绘制轨迹估计弹弓,以及由tradeSeq平滑估计。此外,它允许使用ggplot2弹弓轨迹的可视化。

作者:赫克托耳Roux de Bezieux aut,施莱,凯利街(aut,施莱),柯恩Van den Berge (aut (cre)

维修工:柯恩Van den Berge <柯恩。在gmail.com vdberge >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“traviz”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“traviz”)

HTML	R脚本	ggplot2 +弹弓
HTML	R脚本	traviz
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneExpression,RNASeq,测序,SingleCell,软件,转录组,可视化
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.14 (r - 4.1)(1年)
许可证	麻省理工学院+文件许可
取决于	R (> = 4.0)
进口	ggplot2,冬青,mgcv,SingleCellExperiment,弹弓,princurve,Biobase、方法、RColorBrewer,SummarizedExperimentgrDevices图形,rgl
链接
建议	嘘,dplyr,testthat(> = 3.0.0),covr,S4Vectors,rmarkdown,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	traviz_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	traviz_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64)	traviz_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/traviz
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ traviz
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/traviz/
包下载报告	下载数据