sparseMatrixStats

DOI:10.18129 / B9.bioc.sparseMatrixStats

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅sparseMatrixStats

汇总统计数据稀疏矩阵的行和列

Bioconductor版本:3.15

高性能功能对稀疏矩阵行和列的操作。例如:/ rowMeans2上校,上校/ rowMedians坳/ rowvar等。目前,优化仅限于列中的数据稀疏格式。这个包是受Henrik Bengtsson matrixStats包。

作者:江诗丹顿Ahlmann-Eltze (aut (cre)

维护人员:江诗丹顿Ahlmann-Eltze < artjom31415 googlemail.com >

从内部引用(R,回车引用(“sparseMatrixStats”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“sparseMatrixStats”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“sparseMatrixStats”)

HTML R脚本 sparseMatrixStats
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews DataRepresentation,基础设施,软件
版本 1.8.0
Bioconductor自 BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于 MatrixGenerics(> = 1.5.3)更正
进口 Rcpp,矩阵,matrixStats(> = 0.60.0)方法
链接 Rcpp
建议 testthat(> =魅惑,knitr,板凳上,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements c++ 11
增强了
URL https://github.com/const-ae/sparseMatrixStats
BugReports https://github.com/const-ae/sparseMatrixStats/issues
取决于我
进口我 atena,DelayedMatrixStats,GSVA
建议我 MatrixGenerics,scPCA
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 sparseMatrixStats_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 sparseMatrixStats_1.8.0.zip
macOS二进制(x86_64) sparseMatrixStats_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sparseMatrixStats
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sparseMatrixStats
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/sparseMatrixStats/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网