snapCGH

DOI:10.18129 / B9.bioc.snapCGH

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅snapCGH

aCGH数据的分割,正常化和处理

Bioconductor版本:3.15

分段的方法,正常化和处理aCGH数据;包括绘图函数想象原始和单个和多个分段数据数组。

作者:迈克·l·史密斯,约翰·c·Marioni史蒂文·麦金尼托马斯•Hardcastle娜塔莉·p·索恩

维护人员:约翰Marioni < Marioni在ebi.ac.uk >

从内部引用(R,回车引用(“snapCGH”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“snapCGH”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“snapCGH”)

PDF R脚本 分割概述
PDF 参考手册

细节

biocViews CopyNumberVariation,微阵列,预处理,软件,TwoChannel
版本 1.66.0
Bioconductor自 BioC 1.8 (r - 2.3)(16.5年)
许可证 GPL
取决于 R (> = 3.5.0)
进口 aCGH,集群,DNAcopy,很高兴、图形、grDeviceslimma、方法、统计数据tilingArray,跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我 ADaCGH2
建议我 beadarraySNP
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 snapCGH_1.66.0.tar.gz
Windows二进制 snapCGH_1.66.0.zip
macOS二进制(x86_64) snapCGH_1.66.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/snapCGH
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ snapCGH
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/snapCGH/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网