sechm

DOI:10.18129 / B9.bioc.sechm

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅sechm。

从SummarizedExperiment sechm:复杂的热图

Bioconductor版本:3.15

sechm SummarizedExperiment之间提供了一个简单的接口对象和ComplexHeatmap包。它使策划注释从SE对象的热图,构成了rowData colData列,容易获得和实现的特性使一代的热图更容易也更灵活。这些功能用于SEtools一揽子计划的一部分。

作者:Pierre-Luc日尔曼(cre, aut)

维护人员:Pierre-Luc日尔曼< Pierre-Luc。日尔曼在hest.ethz.ch >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“sechm”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“sechm”)

HTML	R脚本	sechm
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,软件,可视化
版本	1.4.1
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0)
进口	S4Vectors,SummarizedExperiment,系列化,ComplexHeatmap,circlize、方法、randomcoloR、统计数据、网格grDevices,matrixStats
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/plger/sechm
取决于我
进口我	SEtools
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	sechm_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	sechm_1.4.1.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	sechm_1.4.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sechm
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sechm
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/sechm/
包下载报告	下载数据