schex

DOI:10.18129 / B9.bioc.schex

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅schex。

Hexbin情节单一细胞组学数据

Bioconductor版本:3.15

构建hexbin情节为变量和降维存储在单个细胞组学数据SingleCellExperiment和SeuratObject等。这个包中使用的想法是基于卡尔丹的佳作,尼古拉斯·Lewin-Koh马丁Maechler和托马斯广告看板。

作者:Saskia Freytag

维护人员:Saskia Freytag < saskia.freytag在perkins.uwa.edu.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“schex”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“schex”)

HTML	R脚本	multi_modal_schex
HTML	R脚本	picking_the_right_resolution
HTML	R脚本	Seurat_schex
HTML	R脚本	shiny_schhex
HTML	R脚本	using_schex
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction,测序,SingleCell,软件,可视化
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(3年)
许可证	GPL-3
取决于	SingleCellExperiment(> = 1.7.4),修拉,ggplot2(> = 3.2.1),闪亮的
进口	hexbin、统计数据、方法集群,dplyr,熵,ggforce,尺度、网格concaveman
链接
建议	ggrepel,knitr,rmarkdown,testthat(> =魅惑,covr,TENxPBMCData,嘘,shinydashboard,iSEE,igraph,食物
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/SaskiaFreytag/schex
BugReports	https://github.com/SaskiaFreytag/schex/issues
取决于我
进口我	scTensor,scTGIF
建议我	fcoex
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	schex_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	schex_1.10.0.zip
macOS二进制(x86_64)	schex_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/schex
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ schex
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/schex/
包下载报告	下载数据