这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅scds。
Bioconductor版本:3.15
在单个细胞RNA序列(scRNA-seq)数据的组合细胞有时被认为是一个细胞(对比)。scds包中提供了注解的方法对比scRNA-seq数据计算。
作者:丹尼斯Kostka (aut (cre),姨Abha (aut)
维护人员:丹尼斯Kostka < Kostka pitt.edu >
从内部引用(R,回车引用(scds)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(scds)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (scds)
HTML | R脚本 | 介绍scds包 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 分类,GeneExpression,预处理,质量控制,RNASeq,测序,SingleCell,软件,转录组 |
版本 | 1.12.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.9 (r - 3.6)(3.5年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 3.6.0) |
进口 | 矩阵,S4Vectors,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,xgboost、方法、统计数据dplyr,pROC |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rsvd,Rtsne,嘘,cowplot,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | singleCellTK |
建议我 | ExperimentSubset,muscData |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | scds_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | scds_1.12.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | scds_1.12.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scds |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scds |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/scds/ |
包下载报告 | 下载数据 |