scMAGeCK

DOI:10.18129 / B9.bioc.scMAGeCK

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅scMAGeCK。

识别与多个表达式表型相关的基因在单细胞CRISPR筛选数据

Bioconductor版本:3.15

scMAGeCK是一个计算模型来识别与多个相关的基因表达表型从CRISPR筛选加上单细胞RNA序列数据(CROP-seq)

作者:林枭龙Cheng Wei Li Yang

维修工:枭龙程< xiaolongcheng1120 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“scMAGeCK”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“scMAGeCK”)

HTML	R脚本	scMAGeCK
PDF		参考手册

细节

biocViews	CRISPR,GeneExpression,PooledScreens,RNASeq,回归,SingleCell,软件,转录组
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	BSD_2_clause
取决于
进口	修拉,ggplot2统计,跑龙套
链接
建议	knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	scMAGeCK_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	scMAGeCK_1.8.0.zip
macOS二进制(x86_64)	scMAGeCK_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scMAGeCK
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scMAGeCK
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scMAGeCK/
包下载报告	下载数据