散粒

DOI:10.18129 / B9.bioc.scHOT

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅散粒。

单细胞高阶测试

Bioconductor版本:3.15

单细胞高阶测试(散粒)是一个R包,促进测试的高阶结构基因表达的变化以及发展轨迹或跨空间。散粒一般和模块化,可以运行在多个数据的上下文,如连续轨迹,离散群体之间,和在空间取向;以及适应任何高阶测量如可变性或相关性。散粒显著增加了一阶效应测试,如微分表达式,提供了一个框架,用于询问高阶从单细胞数据交互。

作者:Shila Ghazanfar (aut (cre) Yingxin林(aut)

维护人员:Shila Ghazanfar < shazanfar gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(散粒)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(散粒)

HTML	R脚本	开始:散粒
PDF		参考手册

细节

biocViews	GeneExpression,RNASeq,测序,SingleCell,软件,转录组
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0)
进口	S4Vectors(> = 0.24.3),SingleCellExperiment,矩阵,SummarizedExperiment,IRanges、方法、统计数据BiocParallel,重塑,ggplot2,igraphgrDevices,ggforce、图形
链接
建议	knitr,减价,rmarkdown,嘘,scattermore,尺度,matrixStats,deldir
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	scHOT_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	scHOT_1.8.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	scHOT_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scHOT
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/散粒
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scHOT/
包下载报告	下载数据