这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅scDD。
Bioconductor版本:3.15
这个方案实现了一个方法来分析单细胞RNA - seq数据利用灵活的狄利克雷过程混合模型。分布差异表达基因分为几个有趣的模式两种情况之间的差异。包还包括函数模拟数据与这些模式从负二项分布。
维护人员:基冈Korthauer <基冈在stat.ubc.ca >
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):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“scDD”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
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R脚本 | scDD快速入门 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 贝叶斯,聚类,DifferentialExpression,ImmunoOncology,MultipleComparison,RNASeq,SingleCell,软件,可视化 |
版本 | 1.20.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.5 (r - 3.4)(5.5年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 3.5.0) |
进口 | 字段,mclust,BiocParallel,离群值,ggplot2,EBSeq,手臂,SingleCellExperiment,SummarizedExperimentgrDevices,图形,统计数据,S4Vectors,食物 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,gridExtra |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/kdkorthauer/scDD |
BugReports | https://github.com/kdkorthauer/scDD/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 飞溅 |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | scDD_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | scDD_1.20.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | scDD_1.20.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scDD |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scDD |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/scDD/ |
包下载报告 | 下载数据 |