sangerseqR

DOI:10.18129 / B9.bioc.sangerseqR

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅sangerseqR。

工具在R Sanger测序数据

Bioconductor版本:3.15

这个包包含几个工具分析R Sanger测序数据文件,包括阅读.scf和.ab1文件,使basecalls和图绘制色谱图。

作者:乔纳森·t·希尔,布拉德利Demarest

乔纳森·希尔在byu.edu < jhill维护者:>

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“sangerseqR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“sangerseqR”)

PDF	R脚本	sangerseqR
PDF		参考手册

细节

biocViews	单核苷酸多态性,测序,软件,可视化
版本	1.32.0
Bioconductor自	BioC 2.14 (r - 3.1)(8.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.0.2),Biostrings
进口	方法,闪亮的
链接
建议	BiocStyle,knitr,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	sangeranalyseR
进口我
建议我	CrispRVariants
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	sangerseqR_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	sangerseqR_1.32.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	sangerseqR_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sangerseqR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sangerseqR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/sangerseqR/
包下载报告	下载数据