sSNAPPY

DOI:10.18129 / B9.bioc.sSNAPPY

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅sSNAPPY。

单样本定向路径扰动分析

Bioconductor版本:3.15

单个样本通道扰动RNA-seq数据的测试方法。方法将基因表达变化的基因簇拓扑计算single-sample定向路径扰动分数反映潜在的变化方向。微扰分数可用于测试的意义途径扰动individual-sample和治疗水平。

作者:蒙牛刘(aut (cre)

维护人员:蒙牛刘<蒙牛。刘在adelaide.edu.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“sSNAPPY”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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HTML	R脚本	单样本定向路径扰动分析
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细节

biocViews	GeneExpression,GeneSetEnrichment,GeneSignaling,软件
版本	1.0.2中
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.2.0)
进口	dplyr,magrittr,rlang统计数据,plyr,purrr,BiocParallel,石墨,Rcpp,宠物猫,ggplot2,ggraph,igraph,reshape2,org.Hs.eg.db,SummarizedExperiment,刨边机、方法
链接	Rcpp,RcppArmadillo
建议	BiocManager,BiocStyle,cowplot,DT,knitr,老鸨,rmarkdown,拼写,stringr,testthat(> = 3.0.0),tidyverse
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://wenjun-liu.github.io/sSNAPPY/
BugReports	https://github.com/Wenjun-Liu/sSNAPPY/issues
取决于我
进口我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	sSNAPPY_1.0.2.tar.gz
Windows二进制	sSNAPPY_1.0.2.zip
macOS二进制(x86_64)	sSNAPPY_1.0.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sSNAPPY
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sSNAPPY
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/sSNAPPY/
包下载报告	下载数据