quantro

DOI:10.18129 / B9.bioc.quantro

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅quantro。

测试时使用分位数正常化

Bioconductor版本:3.15

一个数据驱动测试的假设分位数正常化使用对象继承eset等原始数据(例如ExpressionSet, MethylSet)。组级别每个样本的信息(如肿瘤/正常状态)也必须提供,因为测试评估如果有全球用户定义的组间的分布差异。

作者:斯蒂芬妮·希克斯(aut (cre)拉斐尔•伊(aut)

维护人员:斯蒂芬妮·希克斯< shicks19 jhu.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“quantro”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“quantro”)

HTML	R脚本	quantro用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	微阵列,MultipleComparison,归一化,预处理,测序,软件
版本	1.30.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(8年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	R (> = 4.0)
进口	Biobase,minfi,doParallel,foreach,迭代器,ggplot2、方法、RColorBrewer
链接
建议	rmarkdown,knitr,RUnit,BiocGenerics,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	纱
建议我	qsmooth
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	quantro_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	quantro_1.30.0.zip
macOS二进制(x86_64)	quantro_1.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/quantro
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ quantro
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/quantro/
包下载报告	下载数据