qsmooth

DOI:10.18129 / B9.bioc.qsmooth

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅qsmooth。

光滑的分位数正常化

Bioconductor版本:3.15

光滑的分位数正常化是一个泛化的分位数正常化,这是平均两种假设的数据生成过程:分位数正常化和分位数之间的标准化组织。

作者:斯蒂芬妮·c·希克斯(aut (cre),夸梅Okrah (aut),柯恩Van den Berge[所有],赫克托耳Corrada布拉沃(aut)拉斐尔•伊(aut)

维护人员:斯蒂芬妮·c·希克斯< shicks19 jhu.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“qsmooth”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“qsmooth”)

HTML	R脚本	qsmooth用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect,微阵列,MultipleComparison,归一化,预处理,RNASeq,测序,软件
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(3.5年)
许可证	CC 4.0
取决于	R (> = 4.0)
进口	SummarizedExperiment跑龙套,股东价值分析、数据、方法、图形Hmisc
链接
建议	bodymapRat,quantro,knitr,rmarkdown,BiocStyle,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	qsmooth_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	qsmooth_1.12.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	qsmooth_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qsmooth
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ qsmooth
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/qsmooth/
包下载报告	下载数据