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qpgraph
DOI:10.18129 / B9.bioc.qpgraph
这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅qpgraph。
估计的遗传和分子从高通量基因组学数据监管网络
Bioconductor版本:3.15
估计从高通量基因和eQTL网络表达和基因分型检测。
作者:罗伯特Castelo (aut (cre),阿尔贝托Roverato (aut)
维护人员:罗伯特Castelo <罗伯特。在upf.edu castelo >
从内部引用(R,回车引用(“qpgraph”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“qpgraph”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“qpgraph”)
| BasicUsersGuide.pdf | ||
| R脚本 | 估计使用qpgraph eQTL网络 | |
| R脚本 | 逆向工程使用qpgraph转录调控网络 | |
| R脚本 | 使用qpgraph模拟分子调控网络 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneExpression,GeneRegulation,GeneticVariability,遗传学,GraphAndNetwork,微阵列,NetworkInference,通路,单核苷酸多态性,软件,转录 |
| 版本 | 2.30.2 |
| Bioconductor自 | BioC 2.4 (r - 2.9)(13.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.5) |
| 进口 | 方法、并行矩阵(> = 1.4 1)、网格注释,图(> = 1.45.1),Biobase,S4Vectors,BiocParallel,AnnotationDbi,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,GenomicFeatures,mvtnorm,qtl,Rgraphviz |
| 链接 | |
| 建议 | RUnit,BiocGenerics,BiocStyle,genefilter,org.EcK12.eg.db,rlecuyer,雪,类别,GOstats |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/rcastelo/qpgraph |
| BugReports | https://github.com/rcastelo/rcastelo/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 限幅器 |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | qpgraph_2.30.2.tar.gz |
| Windows二进制 | qpgraph_2.30.2.zip |
| macOS二进制(x86_64) | qpgraph_2.30.2.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/qpgraph |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ qpgraph |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/qpgraph/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
