ptairMS

DOI:10.18129 / B9.bioc.ptairMS

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ptairMS。

预处理PTR-TOF-MS数据

Bioconductor版本:3.15

这个方案实现了一套方法预处理数据从PTR-TOF-MS仪器(HDF5格式)并生成的样本特征表的峰值强度除了样本和特征元数据(singl

作者:卡米尔Roquencourt (aut (cre)

维护人员:卡米尔Roquencourt <卡米尔。在hotmail.fr roquencourt >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ptairMS”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ptairMS”)

HTML	R脚本	ptaiMS: PTR-TOF-MS数据的处理和分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐,MassSpectrometry,代谢组学,PeakDetection,预处理,软件
版本	1.4.1
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	Biobase,bit64,时间,data.table,doParallel,DT,enviPat,foreach,ggplot2、图形、grDevicesggpubr,gridExtra,Hmisc、方法、minpack.lm,MSnbase平行,情节,rhdf5,rlang,Rcpp,闪亮的,shinyscreenshot,信号,尺度统计,跑龙套
链接	Rcpp
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle,testthat(> =魅惑,ptairData,ropls
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/camilleroquencourt/ptairMS/issues
取决于我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ptairMS_1.4.1.tar.gz
Windows二进制	ptairMS_1.4.1.zip
macOS二进制(x86_64)	ptairMS_1.4.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ptairMS
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ptairMS
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ptairMS/
包下载报告	下载数据