地球
DOI:10.18129 / B9.bioc.planet
这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅地球。
胎盘DNA甲基化分析工具
Bioconductor版本:3.15
这个包包含R函数推断出额外的生物变量对胎盘补充DNA甲基化分析数据。这包括推断种族/祖先,胎龄,从胎盘细胞组成DNA甲基化数组(450 k / 850 k)数据。包提供了一个示例数据集处理胎盘。
作者:维克多元(aut (cre),温迪·p·罗宾逊(施)
维护人员:维克多元<维克多。2王寅gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“行星”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“行星”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“行星”)
| HTML | R脚本 | 地球 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | CpGIsland,DNAMethylation,DifferentialMethylation,表观遗传学,MethylationArray,微阵列,软件 |
| 版本 | 1.4.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 4.0) |
| 进口 | 方法,宠物猫,magrittr,dplyr |
| 链接 | |
| 建议 | ggplot2,testthat,tidyr,尺度,minfi,EpiDISH,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://victor.rbind.io/planethttp://github.com/wvictor14/planet |
| BugReports | http://github.com/wvictor14/planet/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | methylclock |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | planet_1.4.0.tar.gz |
| Windows二进制 | planet_1.4.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | planet_1.4.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/planet |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/星球 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/planet/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
