pepXMLTab

DOI:10.18129 / B9.bioc.pepXMLTab

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅pepXMLTab。

基于肽罗斯福解析pepXML文件和过滤器。

Bioconductor版本:3.15

解析pepXML文件建立一个XML包。包试图从不同的软件处理pepXML文件生成的。输出将peptide-spectrum-matching表格文件。包还提供功能来过滤根据罗斯福psm。

作者:小菁王

维护人员:小菁王<小菁。王在vanderbilt.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“pepXMLTab”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“pepXMLTab”)

PDF	R脚本	介绍pepXMLTab
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,软件
版本	1.30.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(8年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.0.1)
进口	XML(> = 3.98 - -1.1)
链接
建议	RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	pepXMLTab_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	pepXMLTab_1.30.0.zip
macOS二进制(x86_64)	pepXMLTab_1.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pepXMLTab
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pepXMLTab
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pepXMLTab/
包下载报告	下载数据