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DOI:10.18129 / B9.bioc.pageRank

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅网页排名。

时间和多路复用pr基因调控网络分析

Bioconductor版本:3.15

实现时间PageRank分析Rozenshtein和Gionis所定义的。实现多路复用PageRank Halu等。应用所定义的时间和多路复用PageRank在基因调控网络分析。

作者:经由丁(cre aut,施莱,cph]

维护人员:经由叮< hd2326 columbia.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“pageRank”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“pageRank”)

PDF	R脚本	introduction.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneTarget,网络,软件,StatisticalMethod
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(2年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 4.0)
进口	GenomicRanges,igraph,motifmatchr统计,跑龙套,grDevices图形
链接
建议	bcellViper,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,JASPAR2018,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,org.Hs.eg.db,TFBSTools,GenomicFeatures,注释
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/hd2326/pageRank
BugReports	https://github.com/hd2326/pageRank/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	pageRank_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	pageRank_1.6.0.zip
macOS二进制(x86_64)	pageRank_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pageRank
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/网页排名
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/pageRank/
包下载报告	下载数据