这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅omicRexposome。
Bioconductor版本:3.15
omicRexposome目前常用曝光和使数据之间的关联评价,利用MultiDataSet协调数据管理、rexposome exposome数据定义和limma协会测试。也执行数据集成混合exposome和使用多co-inherent使数据分析(omicade4)和multi-canonical相关分析(PMA)。
作者:Carles Hernandez-Ferrer (aut (cre),胡安·r·冈萨雷斯(aut)
维护人员:Xavier Escriba梦特娇< xavier.escriba isglobal.org >
从内部引用(R,回车引用(“omicRexposome”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“omicRexposome”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“omicRexposome”)
HTML | R脚本 | 使数据Exposome数据集成 |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | DifferentialExpression,DifferentialMethylation,表观遗传学,GeneExpression,GeneRegulation,ImmunoOncology,MultipleComparison,蛋白质组学,回归,软件,StatisticalMethod,转录组,可视化,WorkflowStep |
版本 | 1.18.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(5年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 3.5.0),Biobase |
进口 | 属性,跑龙套,grDevices、图形的方法,rexposome,limma,股东价值分析,ggplot2,ggrepel,PMA,omicade4,gridExtra,MultiDataSet,SmartSVA,isva平行,SummarizedExperiment,stringr |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,snpStats,brgedata |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | omicRexposome_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | omicRexposome_1.18.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | omicRexposome_1.18.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/omicRexposome |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ omicRexposome |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/omicRexposome/ |
包下载报告 | 下载数据 |