miRNAtap

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRNAtap

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅miRNAtap

miRNAtap:微目标-聚合的预测

Bioconductor版本:3.15

包方便的实现工作流需要microrna的预测,它允许集成网上排名来自多个源的microrna的目标预测,总以各种方法可以改善预测的质量高于任何单一来源。目前可用于预测智人,亩肌肉和鼠形(最后一个通过同源性翻译)。

作者:Maciej Pajak, t .伊恩·辛普森

维修工:t伊恩·辛普森<伊恩。辛普森在ed.ac.uk >

从内部引用(R,回车引用(“miRNAtap”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“miRNAtap”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“miRNAtap”)

PDF R脚本 miRNAtap
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 分类,微阵列,测序,软件,microrna的
版本 1.30.0
Bioconductor自 BioC 3.0 (r - 3.1)(8年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 3.3.0),AnnotationDbi
进口 DBI,RSQLite,stringr,sqldf,plyr、方法
链接
建议 topGO,org.Hs.eg.db,miRNAtap.db,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 miRNAtap.db
进口我 miRNAtap.db,SpidermiR
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 miRNAtap_1.30.0.tar.gz
Windows二进制 miRNAtap_1.30.0.zip
macOS二进制(x86_64) miRNAtap_1.30.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRNAtap
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miRNAtap
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/miRNAtap/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
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