metagene2

DOI:10.18129 / B9.bioc.metagene2

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅metagene2

一个包生产metagene情节

Bioconductor版本:3.15

这个包产生metagene情节比较保险的测序实验选定群组内的基因组区域。等分析可用于评估DNA-interacting蛋白质的绑定或测量反义转录启动子区域基因的长度。metagene2包可以管理所有方面的分析,从保险正常化情节方面根据试验元数据。引导指令分析是用来提供样品的意思是保险的置信区间。

作者:埃里克·弗尔涅(cre, aut]查尔斯·乔利Beauparlant (aut),塞德里克信托(aut) Arnaud所有权(aut)

维修工:埃里克·弗尔涅< ericfournier2在yahoo.ca >

从内部引用(R,回车引用(“metagene2”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“metagene2”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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HTML R脚本 介绍metagene2
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 对齐,ChIPSeq,报道,遗传学,MultipleComparison,测序,软件
版本 1.12.0
Bioconductor自 BioC 3.9 (r - 3.6)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 4.0),R6(> = 2.0),GenomicRanges,BiocParallel
进口 rtracklayer、工具、GenomicAlignments,GenomeInfoDb,IRanges,ggplot2,Rsamtools,purrr,data.table、方法、dplyr,magrittr,reshape2
链接
建议 BiocGenerics,RUnit,knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/ArnaudDroitLab/metagene2
BugReports https://github.com/ArnaudDroitLab/metagene2/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 metagene2_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 metagene2_1.12.0.zip
macOS二进制(x86_64) metagene2_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metagene2
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ metagene2
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/metagene2/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网