这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅makecdfenv。
Bioconductor版本:3.15
这个包有两个功能。一个读取Affymetrix芯片描述文件(CDF)并创建一个哈希表环境包含位置/探针集员映射。另外创建一个包,自动加载该环境。
作者:拉斐尔·a·伊<拉法在jhu.edu >, Laurent Gautier < cbs.dtu劳伦。dk >, <沃尔夫冈Huber w。胡贝尔在dkfz-heidelberg.de >,本Bolstad < bmb bmbolstad.com >
维修工:詹姆斯·w·麦克唐纳在u.washington.edu < jmacdon >
从内部引用(R,回车引用(“makecdfenv”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“makecdfenv”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“makecdfenv”)
R脚本 | makecdfenv底漆 | |
参考手册 |
biocViews | DataImport,OneChannel,预处理,软件 |
版本 | 1.72.0 |
Bioconductor自 | BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 17.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | R (> = 2.6.0),affyio |
进口 | Biobase,affy、方法、统计跑龙套,zlibbioc |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | altcdfenvs |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | makecdfenv_1.72.0.tar.gz |
Windows二进制 | makecdfenv_1.72.0.zip(64位) |
macOS二进制(x86_64) | makecdfenv_1.72.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/makecdfenv |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ makecdfenv |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/makecdfenv/ |
包下载报告 | 下载数据 |