illuminaio

DOI:10.18129 / B9.bioc.illuminaio

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅illuminaio。

解析Illumina公司微阵列输出文件

Bioconductor版本:3.15

工具解析Illumina公司的微阵列输出文件,包括IDAT。

作者:凯斯·巴格利(aut),亨利克·本特松(aut) Kasper丹尼尔·汉森(aut (cre),马特·里奇(aut),迈克·l·史密斯(aut)蒂姆Triche Jr .)(施)

维修工:Kasper丹尼尔·汉森< kasperdanielhansen gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“illuminaio”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“illuminaio”)

PDF		加密IDAT格式的描述
PDF	R脚本	介绍illuminaio
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,基础设施,微阵列,ProprietaryPlatforms,软件
版本	0.38.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(9.5年)
许可证	GPL-2
取决于
进口	base64
链接
建议	RUnit,BiocGenerics,IlluminaDataTestFiles(> = 1.0.2中),BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/HenrikBengtsson/illuminaio
BugReports	https://github.com/HenrikBengtsson/illuminaio/issues
取决于我	EGSEA123,normalize450K,RnBeads,西瓜
进口我	beadarray,bigmelon,冠军,crlmm,ENmix,methylumi,minfi,芝麻
建议我	limma
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	illuminaio_0.38.0.tar.gz
Windows二进制	illuminaio_0.38.0.zip
macOS二进制(x86_64)	illuminaio_0.38.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/illuminaio
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ illuminaio
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/illuminaio/
包下载报告	下载数据