gwascat

DOI:10.18129 / B9.bioc.gwascat

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅gwascat。

EMBL-EBI GWAS的表示和建模数据目录

Bioconductor版本:3.15

表示和模型数据在EMBL-EBI GWAS目录。

作者:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

维修工:VJ凯里< stvjc channing.harvard.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“gwascat”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“gwascat”)

HTML	R脚本	gwascat——农庄GWAS在EBI目录
HTML	R脚本	gwascat:结构和查询NHGRI GWAS目录
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	遗传学,软件
版本	2.28.1
Bioconductor自	BioC 2.10 (r - 2.15)(10.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 3.5.0)方法
进口	S4Vectors(> = 0.9.25),IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges(> = 1.29.6),GenomicFeatures,readr,Biostrings,AnnotationDbi,BiocFileCache,snpStats,VariantAnnotation,AnnotationHub
链接
建议	DO.db,DT,knitr,RBGL,testthat,rmarkdown,Gviz,Rsamtools,IRanges,rtracklayer,图,ggbio,DelayedArray,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,org.Hs.eg.db,BiocStyle
SystemRequirements
增强了	SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37
URL
取决于我	liftOver,vtpnet
进口我	circRNAprofiler
建议我	GenomicScores,grasp2db,hmdbQuery,ldblock,parglms,TFutils
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	gwascat_2.28.1.tar.gz
Windows二进制	gwascat_2.28.1.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	gwascat_2.28.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwascat
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ gwascat
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/gwascat/
包下载报告	下载数据