图
DOI:
10.18129 / B9.bioc.graph
这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅图。
图:一个包来处理图形数据结构
Bioconductor版本:3.15
一个包,它实现了一些简单的图形处理能力。
作者:r .绅士,伊丽莎白·惠伦w·胡贝尔猎鹰
维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(图)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(图)
细节
biocViews |
GraphAndNetwork,软件 |
版本 |
1.74.0 |
Bioconductor自 |
BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 17.5年) |
许可证 |
艺术- 2.0 |
取决于 |
R(> = 2.10),方法,BiocGenerics(> = 0.13.11) |
进口 |
统计数据、stats4跑龙套 |
链接 |
|
建议 |
SparseM(> = 0.36),XML,RBGL,RUnit,集群 |
SystemRequirements |
|
增强了 |
Rgraphviz |
URL |
|
取决于我 |
apComplex,biocGraph,BioMVCClass,生命网络,BLMA,CellNOptR,限幅器,CNORfeeder,EnrichmentBrowser,flowMerge,群,GOstats,GraphAT,GRridge,GSEABase,超图,keggorthology,maigesPack,MineICA,pathRender,Pigengene,pkgDepTools,PoTRA,ppiData,RbcBook1,RBGL,RBioinf,RCyjs,Rgraphviz,ROntoTools,SNAData,SRAdb,topGO,vtpnet,yeastExpData |
进口我 |
高山,AnnotationHubData,BgeeDB,BiocCheck,biocGraph,BiocOncoTK,BiocPkgTools,biocViews,BioPlex,bnem,相机,类别,categoryCompare,chimeraviz,ChIPpeakAnno,CHRONOS,CytoML,dce,DEGraph,DEsubs,epiNEM,EventPointer,fgga,flowCL,flowClust,flowUtils,flowWorkspace,计,GAPGOM,GeneNetworkBuilder,GenomicInteractionNodes,GOSim,GraphAT,石墨,hyperdraw,KEGGgraph,keggorthology,keggorthology,MIGSA,mirIntegrator,mnem,NCIgraph,NeighborNet,netresponse,OncoSimulR,ontoProc,openCyto,oposSOM,OrganismDbi,pathview,亲,PhenStat,pkgDepTools,ppiStats,pwOmics,qpgraph,RCy3,RGraph2js,RpsiXML,rsbml,Rtreemix,SplicingGraphs,拖缆,trackViewer,VariantFiltering |
建议我 |
AnnotationDbi,DAPAR,DEGraph,EBcoexpress,ecolitk,gwascat,KEGGlincs,中长期规划,NetPathMiner,rBiopaxParser,RCX,rTRM,S4Vectors,SPIA,VariantTools |
我的链接 |
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构建报告 |
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包档案
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指示在R会话中使用这个包。