gmoviz

DOI:10.18129 / B9.bioc.gmoviz

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅gmoviz。

无缝的可视化复杂基因转基因生物和编辑细胞系的变化

Bioconductor版本:3.15

转基因生物(GMOs)和细胞系广泛应用模型在各种各样的生物研究。作为这些模型描述的一部分,DNA测序技术和生物信息学分析系统用于研究他们的基因组。因此,大量的数据生成和各种算法应用于分析这些数据,引入了一个挑战在代表所有发现信息和简洁的方式。“gmoviz”为用户提供了一种简单的方式来想象和促进复杂基因组编辑事件的解释更大,与生物相关的规模。

作者:凯萨琳Zeglinski (cre, aut),亚瑟许(aut),代孕妈妈Alhamdoosh (aut),康斯坦丁Koutsakis (aut)

维护人员:凯萨琳Zeglinski <凯萨琳。在csl.com.au zeglinski >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“gmoviz”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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HTML	R脚本	先进的使用gmoviz
HTML	R脚本	介绍gmoviz
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文本		新闻

细节

biocViews	报道,GeneticVariability,GenomicVariation,测序,软件,可视化
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	circlize,GenomicRanges、图形、R (> = 4.0)
进口	网格,gridBase,Rsamtools,ComplexHeatmap,BiocGenerics,Biostrings,GenomeInfoDb、方法、GenomicAlignments,GenomicFeatures,IRanges,rtracklayer,pracma,色彩,S4Vectors
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown,pasillaBamSubset,BiocStyle,BiocManager
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	gmoviz_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	gmoviz_1.8.0.zip
macOS二进制(x86_64)	gmoviz_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gmoviz
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ gmoviz
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/gmoviz/
包下载报告	下载数据