geneplotter

DOI:10.18129 / B9.bioc.geneplotter

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅geneplotter

图形为Bioconductor相关功能

Bioconductor版本:3.15

函数绘制基因组数据

作者:r .绅士,Biocore

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

从内部引用(R,回车引用(“geneplotter”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“geneplotter”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“geneplotter”)

PDF R脚本 如何组装chromLocation对象
PDF R脚本 微阵列数据的可视化
PDF 参考手册
文本 自述
文本 新闻

细节

biocViews 软件,可视化
版本 1.74.0
Bioconductor自 BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 17.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(> = 2.10),方法,Biobase,BiocGenerics,晶格,注释
进口 AnnotationDbi、图形grDevices、网格RColorBrewer统计,跑龙套
链接
建议 Rgraphviz,fibroEset,hgu95av2.db,hu6800.db,hgu133a.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 HD2013SGI,Hiiragi2013,maEndToEnd
进口我 biocGraph,DESeq2,DEXSeq,ENmix,IsoGeneGUI,MethylSeekR,RNAinteract
建议我 AgiMicroRna,biocGraph,类别,EnrichmentBrowser,GOstats,Single.mTEC.Transcriptomes
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 geneplotter_1.74.0.tar.gz
Windows二进制 geneplotter_1.74.0.zip
macOS二进制(x86_64) geneplotter_1.74.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geneplotter
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ geneplotter
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/geneplotter/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网