esetVis

DOI:10.18129 / B9.bioc.esetVis

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅esetVis

的可视化expressionSet Bioconductor对象

Bioconductor版本:3.15

效用函数的可视化expressionSet(或SummarizedExperiment) Bioconductor对象,包括光谱图、tsne和线性判别分析。静态图通过ggplot2包或互动通过ggvis rbokeh包是可用的。

作者:罗兰Cougnaud <罗兰。在openanalytics.eu cougnaud >

Laure Cougnaud维护者:<罗兰。在openanalytics.eu cougnaud >

从内部引用(R,回车引用(“esetVis”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“esetVis”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“esetVis”)

HTML R脚本 esetVis包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataRepresentation,DimensionReduction,通路,PrincipalComponent,软件,可视化
版本 1.22.0
Bioconductor自 BioC 3.4 (r - 3.3)(6年)
许可证 GPL-3
取决于
进口 mpm,hexbin,Rtsne,中长期规划、网格Biobase,质量统计,跑龙套,grDevices方法
链接
建议 ggplot2,ggvis,rbokeh,ggrepel,knitr,rmarkdown,所有,hgu95av2.db,AnnotationDbi,老鸨,SummarizedExperiment
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 esetVis_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 esetVis_1.22.0.zip
macOS二进制(x86_64) esetVis_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/esetVis
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ esetVis
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/esetVis/
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