逃避
DOI:10.18129 / B9.bioc.escape
这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅逃避。
简单的单细胞分析平台进行浓缩
Bioconductor版本:3.15
桥接R包促进基因集富集分析(GSEA)的上下文中单细胞RNA序列。使用原始统计信息,修拉的对象,或SingleCellExperiment格式,用户可以执行和可视化GSEA单个细胞。
作者:尼克Borcherding (aut (cre),贾里德·安德鲁斯(aut)
维护人员:尼克Borcherding < ncborch gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“逃离”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“逃脱”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“逃离”)
| HTML | R脚本 | Escape-ingToWork |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 注释,分类,GeneSetEnrichment,GeneSignaling,通路,测序,SingleCell,软件 |
| 版本 | 1.6.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.12 (r - 4.0)(2年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 4.1) |
| 进口 | grDevices,dplyr,ggplot2,GSEABase,GSVA,SingleCellExperiment,ggridges,msigdbr统计数据,BiocParallel,矩阵,UCell,扫帚,reshape2,拼接而成,MatrixGenerics跑龙套,rlang,stringr,data.table,SummarizedExperiment、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | 修拉,SeuratObject,knitr,rmarkdown,减价,BiocStyle,testthat,dittoSeq(> = 1.1.2) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | Cepo |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | escape_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | escape_1.6.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | escape_1.6.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/escape |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/逃跑 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/escape/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
