这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅dyebias。
Bioconductor版本:3.15
很多双色杂交过程受到一种染料gene-specific和slide-specific偏见。前者取决于核苷酸用于标签的内容;后者取决于标签百分比。slide-dependency至今没有公认,解决人工制品是不可能的。鉴于dye-swapped双杂交过程的一个合理的数量,或相同的和相同的杂交过程的基因和slide-biases使用GASSCO方法可以估计和修正(Margaritis et al .,摩尔系统。生物5:266 (2009),doi: 10.1038 / msb.2009.21)
作者:菲利普Lijnzaad Thanasis Margaritis
维护人员:菲利普Lijnzaad < plijnzaad gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“dyebias”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“dyebias”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“dyebias”)
R脚本 | 染料偏差纠正 | |
参考手册 | ||
文本 | 许可证 |
biocViews | 微阵列,预处理,质量控制,软件,TwoChannel |
版本 | 1.56.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.4 (r - 2.9)(13.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 1.4.1),marray,Biobase |
进口 | |
链接 | |
建议 | limma,转换,GEOquery,dyebiasexamples、方法 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.holstegelab.nl/publications/margaritis_lijnzaad |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | dyebiasexamples |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | dyebias_1.56.0.tar.gz |
Windows二进制 | dyebias_1.56.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | dyebias_1.56.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dyebias |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ dyebias |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/dyebias/ |
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