德科
DOI:10.18129 / B9.bioc.deco
这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅德科。
分解异构军团使用使数据分析
Bioconductor版本:3.15
这个包发现异的微分特性和均匀使数据通过一个两步方法包括二次抽样LIMMA NSCA。德科揭示特性关联隐藏子类不仅仅与放松管制水平较高有关。
作者:旧金山Jose Campos-Laborie Jose Manuel Sanchez-Santos和哈维尔·De Las里瓦斯。生物信息学与功能基因组学。癌症研究中心(CiC-IBMCC CSIC / USAL)。萨拉曼卡。西班牙。
维护人员:旧金山何塞·坎波斯Laborie < fjcamlab gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“装饰”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“装饰”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“装饰”)
| HTML | R脚本 | 德科 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 贝叶斯,BiomedicalInformatics,聚类,DifferentialExpression,ExonArray,FeatureExtraction,GeneExpression,MicroRNAArray,微阵列,MultipleComparison,蛋白质组学,RNASeq,测序,软件,转录,转录组,mRNAMicroarray |
| 版本 | 1.12.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.9 (r - 3.6)(3.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 3) |
| 取决于 | R (> = 3.5.0),AnnotationDbi,BiocParallel,SummarizedExperiment,limma |
| 进口 | 统计数据、方法ggplot2,外国、图形、BiocStyle,Biobase,集群,gplots,RColorBrewer,locfit,made4,ade4,sfsmisc,scatterplot3d,gdatagrDevices跑龙套,reshape2,gridExtra |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,curatedTCGAData,MultiAssayExperiment,Homo.sapiens,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/fjcamlab/deco |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | deco_1.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | deco_1.12.0.zip(64位) |
| macOS二进制(x86_64) | deco_1.12.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/deco |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/装饰 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/deco/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
