compEpiTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.compEpiTools

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅compEpiTools。

工具计算表观基因组学

Bioconductor版本:3.15

分析计算表观基因组学工具开发,集成和同步可视化的各种跨多个基因组(epi)基因组学数据类型地区多个样本。

作者:马狄亚(aut),卡基肖尔(aut (cre)

维护人员:Kamal基肖尔<卡马尔。在gmail.com fartiyal84 >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“compEpiTools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“compEpiTools”)

PDF	R脚本	compEpiTools.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道,GeneExpression,GenomeAnnotation,测序,软件,可视化
版本	1.30.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(8年)
许可证	GPL
取决于	R(> = 3.5.0)、方法topGO,GenomicRanges
进口	AnnotationDbi,BiocGenerics,Biostrings,Rsamtools、平行、grDevicesgplots,IRanges,GenomicFeatures,XVector,methylPipe,GO.db,S4Vectors,GenomeInfoDb
链接
建议	BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9,TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene,org.Mm.eg.db,knitr,rtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	compEpiTools_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	compEpiTools_1.30.0.zip
macOS二进制(x86_64)	compEpiTools_1.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/compEpiTools
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ compEpiTools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/compEpiTools/
包下载报告	下载数据