结合
DOI:10.18129 / B9.bioc.combi
这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅结合。
组成的组学基于模型的可视化集成
Bioconductor版本:3.15
这种探究的祝圣礼方法结合quasi-likelihood估计,成分回归模型和潜变量模型综合几个组学数据集的可视化。无约束和约束集成是可用的。结果显示为可判断的,成分的多图。
作者:Stijn Hawinkel (cre, aut)
维护人员:Stijn Hawinkel < Stijn。在psb.ugent.be hawinkel >
从内部引用(R,回车引用(“联合”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“联合”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“联合”)
| HTML | R脚本 | 手册结合pacakage |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DimensionReduction,代谢组学,宏基因组,微生物组,软件,可视化 |
| 版本 | 1.8.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 4.0),DBI |
| 进口 | ggplot2,nleqslv,phyloseq,张量统计数据,limma,矩阵,BB,reshape2,阿拉巴马州,玉米穗轴,Biobase,素食主义者、grDevices、图形、方法SummarizedExperiment |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| BugReports | https://github.com/CenterForStatistics-UGent/combi/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | combi_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | combi_1.8.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | combi_1.8.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/combi |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/联合 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/combi/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
