警戒线

DOI:10.18129 / B9.bioc.coRdon

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅警戒线。

密码子使用基因表达性的分析和预测

Bioconductor版本:3.15

密码子使用的工具分析各种未经或KEGG /齿轮带注释的DNA序列。计算不同措施的铜偏差和预测基因的表现度,可见光谱线并执行基因集富集分析带注释的序列。实现了几种方法对铜和富集分析结果的可视化。

作者:Anamaria Elek (cre, aut], Maja Kuzman (aut),克里斯蒂安Vlahovicek (aut)

维护人员:Anamaria Elek < anamariaelek gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“警戒线”)

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文档

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browseVignettes(“警戒线”)

HTML	R脚本	警戒线
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BiomedicalInformatics,GeneExpression,GenePrediction,GeneSetEnrichment,遗传学CellBiology,ImmunoOncology,KEGG,宏基因组,通路,软件,可视化
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(4年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.5)
进口	方法、统计跑龙套,Biostrings,Biobase,dplyr,stringr,purrr,ggplot2,data.table
链接
建议	BiocStyle,testthat,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/BioinfoHR/coRdon
BugReports	https://github.com/BioinfoHR/coRdon/issues
取决于我
进口我	vhcub
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	coRdon_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	coRdon_1.14.0.zip
macOS二进制(x86_64)	coRdon_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/coRdon
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/警戒线
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/coRdon/
包下载报告	下载数据