clustComp

DOI:10.18129 / B9.bioc.clustComp

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅clustComp

聚类比较包

Bioconductor版本:3.15

clustComp包实现几个比较和可视化的技术不同的聚类结果之间的关系,平面与平面或层次而平坦。这些使用加权bi-graph集群之间的关系显示,节点代表的集群的节点和边缘连接对非空的十字路口;每条边的重量是元素的数量在这个十字路口,通过边缘厚度显示。的最佳布局bi-graph提供的重心算法,最小化加权的口岸。在分层和无等级聚类相比,系统树图是修剪放在不同的高度,选择通过探索树深度优先搜索,从根开始。分支机构决定分割根据得分函数的值,可以的美学bi-graph或基于层次之间的互信息和平坦的集群。之间的映射组各集群采用贪婪算法,并且可以另外形象化。

作者:极光多浪迪警官,艾尔维Brazma。

维护人员:极光多浪迪警官<极光在ebi.ac.uk >

从内部引用(R,回车引用(“clustComp”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“clustComp”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF R脚本 clustComp包
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 聚类,GeneExpression,软件,可视化
版本 1.24.0
Bioconductor自 BioC 3.3 (r - 3.3)(6.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 3.3)
进口 sm、统计数据、图形,grDevices
链接
建议 Biobase,colonCA,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 clustComp_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 clustComp_1.24.0.zip
macOS二进制(x86_64) clustComp_1.24.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clustComp
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ clustComp
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/clustComp/
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