chimeraviz

DOI:10.18129 / B9.bioc.chimeraviz

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅chimeraviz。

基因融合的可视化工具

Bioconductor版本:3.15

chimeraviz管理数据融合基因发现者和提供有用的可视化工具。

作者:Stian Lagstad (aut (cre)森赵(施),安德烈亚斯·m·霍夫(施),Bjarne Johannessen[所有],Ole基督教Lingjærde[所有],Rolf Skotheim(施)

维护人员:Stian Lagstad < stianlagstad gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“chimeraviz”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“chimeraviz”)

HTML	R脚本	chimeraviz
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐,基础设施,软件
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biostrings,GenomicRanges,IRanges,Gviz,S4Vectors,ensembldb,AnnotationFilter,data.table
进口	方法、网格Rsamtools,GenomeInfoDb,GenomicAlignments,RColorBrewer、图形、AnnotationDbi,RCircos,org.Hs.eg.db,org.Mm.eg.db,rmarkdown,图,Rgraphviz,DT,plyr,dplyr,BiocStyle,使彻底失败,gtools,魔法
链接
建议	testthat,roxygen2,devtools,knitr,lintr
SystemRequirements	领结,samtools egrep所需的一些功能
增强了
URL	https://github.com/stianlagstad/chimeraviz
BugReports	https://github.com/stianlagstad/chimeraviz/issues
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	chimeraviz_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	chimeraviz_1.22.0.zip
macOS二进制(x86_64)	chimeraviz_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chimeraviz
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ chimeraviz
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/chimeraviz/
包下载报告	下载数据