分歧点

DOI:10.18129 / B9.bioc.branchpointer

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅分歧点。

预测intronic拼接分歧点

Bioconductor版本:3.15

概率预测分歧点intronic分歧点windows的网站。查询可以提供intronic地区;或评估突变的影响,单核苷酸多态性。

作者:贝丝信号

维护人员:贝丝信号< b。信号在garvan.org.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“分歧点”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“分歧点”)

PDF	R脚本	使用注释intronic人类拼接branchpoints分歧点
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GenomeAnnotation,GenomicVariation,MotifAnnotation,软件
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(5.5年)
许可证	BSD_3_clause +文件许可证
取决于	脱字符号R (> = 3.4)
进口	plyr,kernlab,“绿带运动”,stringr,cowplot,ggplot2,biomaRt,Biostrings平行,跑龙套,统计数据,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38,rtracklayer,GenomicRanges,GenomeInfoDb,IRanges,S4Vectors,data.table
链接
建议	knitr,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	branchpointer_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	branchpointer_1.22.0.zip
macOS二进制(x86_64)	branchpointer_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/branchpointer
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/分歧点
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/branchpointer/
包下载报告	下载数据