北欧化工

DOI:10.18129 / B9.bioc.borealis

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅北欧化工。

在单分辨率Bisulfite-seq异常甲基化

Bioconductor版本:3.15

北欧化工是一个基于R库执行异常值分析点重亚硫酸盐测序数据。它从酸性亚硫酸盐测序检测异常甲基化CpG网站(BS-seq)。北欧化工的核心是建模Beta-Binomial分布。这对罕见疾病的诊断可能是有用的。

作者:Garrett詹金森(aut (cre)

维修工:Garrett詹金森< gargar934 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“北欧化工”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes(“北欧化工”)

HTML	R脚本	北欧化工异常甲基化检测
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文本		新闻

细节

biocViews	报道,DNAMethylation,DifferentialMethylation,测序,软件
版本	1.0.1
Bioconductor自	BioC 3.15 (r - 4.2)(0.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.2.0),Biobase
进口	doParallel,雪,purrr,plyr,foreach,gamlss,gamlss.dist,bsseq、方法、DSS,R.utils,跑龙套,统计数据,ggplot2,cowplot,dplyr,rlang,GenomicRanges
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,RUnit,BiocGenerics,annotatr,tidyr,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,org.Hs.eg.db
SystemRequirements
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	borealis_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	borealis_1.0.1.zip
macOS二进制(x86_64)	borealis_1.0.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/borealis
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/好
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/borealis/
包下载报告	下载数据