这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅beachmat。
Bioconductor版本:3.15
提供了一个一致的c++类接口读取和写入数据,选用多种常用的矩阵类型。普通矩阵和稀疏的几个/稠密矩阵类直接支持,第三方S4类可能是由外部链接,而所有其他矩阵是由DelayedArray块处理。
作者:亚伦Lun (aut (cre), Herve页(aut),迈克·史密斯(aut)
维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“beachmat”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“beachmat”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“beachmat”)
HTML | R脚本 | 1。开发人员指南 |
HTML | R脚本 | 2。读取数据从R矩阵在c++中(v2) |
HTML | R脚本 | 3所示。写数据到R矩阵对象(v2) |
HTML | R脚本 | 4所示。支持任意的矩阵类(v2) |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,DataRepresentation,基础设施,软件 |
版本 | 2.12.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | |
进口 | 方法,DelayedArray(> = 0.15.14),BiocGenerics,矩阵,Rcpp |
链接 | Rcpp |
建议 | testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown,rcmdcheck,BiocParallel,HDF5Array |
SystemRequirements | c++ 11 |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | 后面;,BiocSingular,DropletUtils,mumosa,嘘,食物,天窗,单 |
建议我 | bsseq,glmGamPoi,mbkmeans,PCAtools,scCB2 |
我的链接 | BiocSingular,bsseq,DropletUtils,glmGamPoi,mbkmeans,PCAtools,食物,天窗,单 |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | beachmat_2.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | beachmat_2.12.0.zip(64位) |
macOS二进制(x86_64) | beachmat_2.12.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/beachmat |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ beachmat |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/beachmat/ |
包下载报告 | 下载数据 |