atSNP

DOI:10.18129 / B9.bioc.atSNP

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅atSNP。

亲和力测试确定监管snp

Bioconductor版本:3.15

atSNP执行关联测试的主题匹配SNP或参考基因组和SNP-led相契合的变化。

作者:钱德勒左(aut) Sunyoung胫骨(aut (cre) Sunduz凯尔(aut)

维护人员:Sunyoung Shin < Sunyoung。shin utdallas.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“atSNP”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“atSNP”)

HTML	R脚本	atsnp-vignette.html
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq,GenomeAnnotation,MotifAnnotation,软件,可视化
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(3.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.6)
进口	BSgenome,BiocFileCache,BiocParallel,Rcpp,data.table,ggplot2、grDevices、图形、网格motifStack,rappdirs统计数据,testthat跑龙套,生命周期
链接	Rcpp
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/sunyoungshin/atSNP
BugReports	https://github.com/sunyoungshin/atSNP/issues
取决于我
进口我
建议我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	atSNP_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	atSNP_1.12.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64)	atSNP_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/atSNP
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ atSNP
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/atSNP/
包下载报告	下载数据