arrayQualityMetrics

DOI:10.18129 / B9.bioc.arrayQualityMetrics

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅arrayQualityMetrics。

质量量度报告微阵列数据集

Bioconductor版本:3.15

这个包生成微阵列数据质量度量报告在Bioconductor微阵列数据容器(ExpressionSet, NChannelSet AffyBatch)。1和2的颜色数组支持平台。

作者:沃尔夫冈·胡贝尔奥黛丽•考夫曼

维护人员:迈克史密斯<迈克。史密斯在embl.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“arrayQualityMetrics”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“arrayQualityMetrics”)

PDF	R脚本	高级的主题:定制arrayQualityMetrics报告和编程处理输出
PDF	R脚本	简介:微阵列与arrayQualityMetrics质量评估
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	微阵列,OneChannel,质量控制,ReportWriting,软件,TwoChannel
版本	3.52.0
Bioconductor自	BioC 2.1 (r - 2.6)(15年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于
进口	affy,affyPLM(> = 1.27.3),beadarray,Biobase,genefilter、图形grDevices、网格gridSVG(1.4 > = 3),Hmisc,hwriter,晶格,latticeExtra,limma、方法、RColorBrewer,setRNG,统计,跑龙套,vsn(> = 3.23.3),XML,svglite
链接
建议	ALLMLL,亚兰,BiocStyle,knitr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/grimbough/arrayQualityMetrics/issues
取决于我	maEndToEnd
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	arrayQualityMetrics_3.52.0.tar.gz
Windows二进制	arrayQualityMetrics_3.52.0.zip
macOS二进制(x86_64)	arrayQualityMetrics_3.52.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/arrayQualityMetrics
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ arrayQualityMetrics
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/arrayQualityMetrics/
包下载报告	下载数据