affylmGUI

DOI:10.18129 / B9.bioc.affylmGUI

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅affylmGUI。

GUI与Affymetrix limma包微阵列

Bioconductor版本:3.15

一个图形用户界面(GUI)来分析使用affy Affymetrix微阵列基因表达数据和limma包。

作者:詹姆斯Wettenhall (cre, aut)戈登·史密斯(aut),肯•辛普森(aut)基斯Satterley(施)

维护人员:戈登史密斯<史密斯在wehi.edu.au >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“affylmGUI”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“affylmGUI”)

HTML		about.html
PDF	R脚本	affylmGUI装饰图案
HTML		CustMenu.html
PDF		提取affy和从affylmGUI limma对象文件
HTML		index . html
HTML		windowsFocus.html
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BatchEffect,贝叶斯,DataImport,DifferentialExpression,GUI,GeneExpression,微阵列,MultipleComparison,归一化,OneChannel,预处理,ProprietaryPlatforms,质量控制,回归,软件,TimeCourse,转录,mRNAMicroarray
版本	1.70.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 17.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于
进口	tcltk grDevices、图形、属性、跑龙套,tkrplot,limma,affy,affyio,affyPLM,gcrma,BiocGenerics,AnnotationDbi,BiocManager,R2HTML,xtable
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL	http://bioinf.wehi.edu.au/affylmGUI/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	affylmGUI_1.70.0.tar.gz
Windows二进制	affylmGUI_1.70.0.zip
macOS二进制(x86_64)	affylmGUI_1.70.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affylmGUI
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ affylmGUI
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/affylmGUI/
包下载报告	下载数据