affycoretools

DOI:10.18129 / B9.bioc.affycoretools

这个包是3.15版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅affycoretools。

函数用于那些做重复性分析与Affymetrix GeneChips

Bioconductor版本:3.15

各种包装器函数,写精简分析核心生物可能会看到更为普遍。

作者:詹姆斯·w·麦克唐纳

维修工:詹姆斯·w·麦克唐纳在u.washington.edu < jmacdon >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“affycoretools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“affycoretools”)

HTML	R脚本	创建带注释的输出与\ Biocpkg {affycoretools}和ReportingTools
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,微阵列,OneChannel,ReportWriting,软件
版本	1.68.1
Bioconductor自	BioC 1.8 (r - 2.3)(16.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	Biobase、方法
进口	affy,limma,GOstats,gcrma样条函数,xtable,AnnotationDbi,ggplot2,gplots,oligoClasses,ReportingTools,hwriter,晶格,S4Vectors,刨边机,RSQLite,BiocGenerics,DBI,Glimma
链接
建议	affydata,hgfocuscdf,BiocStyle,knitr,hgu95av2.db,rgl,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	AgiMicroRna
进口我
建议我	EnMCB
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	affycoretools_1.68.1.tar.gz
Windows二进制	affycoretools_1.68.1.zip
macOS二进制(x86_64)	affycoretools_1.68.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/affycoretools
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ affycoretools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/affycoretools/
包下载报告	下载数据